ngày 7.2.2005 máy bay Airbus A320 chở 170 người của Atlasjet trượt khỏi đường băng của Sân bay Atatürk trong thời tiết có tuyết. May là không có người nào bị thương
Ngày 18.8.2007 một máy bay của Atlasjet bay từ Cyprus tới Istanbul bị 2 tên không tặc tự xưng là người của Tổ chức khủng bố quốc tế Al-Qaeda uy hiếp, buộc máy bay phải hạ cánh xuống Antalya và để cho các hành khách ra khỏi máy bay, nhưng giữ lại phi hành đoàn. Sau 4 giờ thương thuyết, 2 tên không tặc Mehmet Resat Ozlu (người Thổ Nhĩ Kỳ) và Abdul Aziz Maliki (người Palestine) đã đầu hàng.
Ngày 30.11.2007 máy bay MD-83 Atlasjet thuê của World Focus Airlines bị rớt gần Isparta (Thổ Nhĩ Kỳ) khiến 57 người thiệt mạng,
